Statistical Inference Methods for Two Crossing Survival Curves: A Comparison of Methods

A common problem that is encountered in medical applications is the overall homogeneity of survival distributions when two survival curves cross each other. A survey demonstrated that under this condition, which was an obvious violation of the assumption of proportional hazard rates, the log-rank test was still used in 70% of studies. Several statistical methods have been proposed to solve this problem. However, in many applications, it is difficult to specify the types of survival differences and choose an appropriate method prior to analysis. Thus, we conducted an extensive series of Monte Carlo simulations to investigate the power and type I error rate of these procedures under various patterns of crossing survival curves with different censoring rates and distribution parameters. Our objective was to evaluate the strengths and weaknesses of tests in different situations and for various censoring rates and to recommend an appropriate test that will not fail for a wide range of applications. Simulation studies demonstrated that adaptive Neyman’s smooth tests and the two-stage procedure offer higher power and greater stability than other methods when the survival distributions cross at early, middle or late times. Even for proportional hazards, both methods maintain acceptable power compared with the log-rank test. In terms of the type I error rate, Renyi and Cramér—von Mises tests are relatively conservative, whereas the statistics of the Lin-Xu test exhibit apparent inflation as the censoring rate increases. Other tests produce results close to the nominal 0.05 level. In conclusion, adaptive Neyman’s smooth tests and the two-stage procedure are found to be the most stable and feasible approaches for a variety of situations and censoring rates. Therefore, they are applicable to a wider spectrum of alternatives compared with other tests.     

基于多尺度协同的长沙市生态网络构建与层级优化

城市化背景下人类与自然环境的矛盾呈现出多尺度、层级化特征，而传统生态网络的构建方式较少考虑不同尺度下生态要素的关系，无法从区域落实到中心城区，难以形成系统性的解决方案。研究在综合梳理各尺度生态网络构建方法的基础上，以长沙市为例，基于形态学空间格局分析（Morphological Spatial Pattern Analysis，MSPA）、景观连通性原理和生态斑块重要性评价识别生态源地，并通过多层级生态阻力面的确定，综合运用最小费用路径（Least-cost path method，LCP）、电路理论、层级传导理论、尺度嵌套等方法对市域、都市区、中心城区的生态网络进行了协同构建和层级优化，最后基于不同尺度生态网络的特点应用并落实到多层级的国土空间规划体系中。研究结果表明：（1）长沙市域生态网络和都市区生态网络具有较好的层级嵌套特征；共识别两尺度生态叠合源地14个、生态叠合廊道15条，主要通过中心城区内的湘江、浏阳河和捞刀河部分河段与外围生态绿圈相衔接，形成"外环内楔"的空间格局。（2）确定市域重要廊道、市域潜在廊道、生态叠合廊道、都市区重要廊道、都市区潜在廊道的核心保护面积共501.14 km²，并提取位于生态廊道核心保护区范围内的生态夹点和生态障碍点，以进一步落实生态保护修复策略。（3）得到具有重要生态连通功能的中心城区生态绿道长度441.2 km，生态修复单元56个，并结合生态阻力值划分为5级进行针对性修复。（4）基于不同尺度生态网络的衔接、嵌套，最终构建"市域总体生态安全格局-都市区城市生态空间发展格局-以城市绿道为基础的中心城区生态修复单元"，并与不同层级的国土空间规划体系相对应。研究结果将为以大城市为中心的跨尺度生态系统修复和生态安全格局构建提供科学参考。     

基于生态系统服务供需的景感尺度特征分析和应用

自然生态系统与人类感知的交互作用是景感生态学关注的焦点，与生态系统服务的供需紧密关联。生态系统、生态过程、生态系统服务以及人的需求均具有一定的时空尺度特征，因此，由这些过程产生的"景感"也具有时空尺度特征，并依赖于这个过程的尺度特征相互作用。梳理生态系统服务供需关系与景感营造规划的尺度特征，探索二者相互联系，进而提出基于景感生态学理论，通过景感营造实现生态系统服务供需平衡的多尺度实现路径。从空间维度，体现从"社区-城市-流域-区域"的多尺度景感规划框架，从应用维度，体现从生态系统服务需求探索-关键指标体系识别-多源谜码数据感知-景感营造与规划设计的具体流程。通过多尺度的联合景感营造，调整自然供给水平与人类不同尺度的生态系统服务需求以期达到平衡，从而实现人类生存环境福利与居民福祉提升的目标。在此基础上，结合雄安新区规划建设实例，从多尺度景感营造的角度为城市绿色生态建设与可持续发展提出优化建议。主要结论：（1）基于"社区-城市-流域-区域"的多尺度景感分析框架，将景感要素与生态系统服务供需思想融入城市规划，在不同尺度上趋善优化，对于实现可持续发展城市规划和管理具有重要指示意义；（2）雄安新区规划设计需更系统和细致地考虑人类感知需求，通过多尺度景感营造设计，共同实现雄安新区的可持续发展与人居环境提升。其中，在社区尺度，需重点关注社区植被配置和居民的休闲游憩；在新区尺度重点关注绿地系统网络构建；在大清河流域尺度重点关注河流健康与水文调节；在京津冀区域尺度需注重山体通风廊道与生态屏障的构建与优化。     

退耕还林还草工程对陕北地区生态系统服务价值时空演变的影响

基于陕北地区1990、2000、2015年土地利用数据，运用单位面积生态系统价值当量因子法、格网法、探索性空间数据法（ESDA），分析了退耕还林还草工程实施前后生态系统服务价值（ESV）的空间分布和演化规律，探讨了退耕还林还草工程对ESV的影响。结果表明：（1）陕北地区退耕还林还草工程实施效果显著，工程实施后共有297066.15 hm2耕地转化为林地和草地，林草覆盖率由57.33%增长至60.50%。（2）退耕还林还草工程使得陕北地区ESV得到了显著提升。25年间陕北地区ESV共增加了32.82亿元，ESV在工程实施后比工程实施前多增加了5.93亿元，增长主要源于退耕引起林地和草地面积的增加。（3）ESV空间分布上呈显著的“南高北低”分布格局，并表现出正向的集聚性和依存性，ESV热点区和冷点区集聚效果明显，热点区集聚与林地、草地的空间分布相吻合，冷点区集聚与未利用地、耕地和建设用地的空间分布相吻合。（4）受退耕还林还草工程影响，陕北地区中部中等等级和次高ESV分布区域逐渐增大、次热点区空间集聚性逐渐增强，北部次低等级和低等级ESV分布区域逐渐减少、冷点区空间集聚性逐渐减弱。整体而言，陕北地区土地利用类型转移和ESV的增减变化与推行退耕还林还草工程在时间上相呼应、在空间上相匹配，退耕还林还草工程实施使得陕北地区生态环境得到了有效改善，ESV得到了显著提升。     

N-糖蛋白去糖基化酶（PNGase）的研究进展

N-糖蛋白去糖基化酶（PNGase）是一种广泛存在于真菌、植物、哺乳动物中的去糖基化酶，可以水解N-糖蛋白或 N-糖肽上天冬酰胺与寡糖链连接的化学键，并释放出完整的N-寡糖。PNGase在生物体内参与蛋白质降解、器官发育、个体生长等过程。人PNGase基因功能缺陷会导致先天性去糖基化障碍，小鼠PNGase缺陷会导致胚胎致死性，线虫PNGase缺陷使其寿命下降。本文对PNGase在不同物种的分布、蛋白质结构、酶学功能及生物学功能进行阐述，为PNGase的生理病理功能及致病机制的基础研究提供思路，为PNGase作为糖生物学工具酶或药物开发的创新应用研究奠定基础。     

Synthesis,Biological Evaluation,and Docking Study of Ring-Opening Amide Analogs of Matrine as Antitumor Agents

In this article, we designed and synthesized two series of matrine analogs with ring-opening in the lactam portion of the molecule. Our in vitro cytotoxicity study showed that analog N-(3-bromophenyl)-4-[(1R,3aS,10aR,10bS)-decahydro-1H,4H-pyrido[3,2,1-ij][1,6]naphthyridin-1-yl]butanamide ( B11 ) with a meta-bromide on the phenyl ring displayed the best antiproliferative activity. Moreover, B11 induced cell cycle arrest in G1 phase and cell apoptosis in a dose-dependent manner in A549 cells. Molecular modeling revealed that B11 achieved a higher docking score compared to its precursor tert-butyl (1R,3aS,10aR,10bS)-1-[4-(3-bromoanilino)-4-oxobutyl]octahydro-1H,4H-pyrido[3,2,1-ij][1,6]naphthyridine-2(3H)-carboxylate ( A11 , an analog of B11 with a Boc group) and parent compound matrine, possibly because B11 formed a hydrogen bond with SER91 and a halogen bond with GLN320 on the binding site of annexin A2. Overall, we discovered the potential anticancer lead compound B11 , which can be used for further study both in vitro and in vivo.